W podręczniku KlikPlik 3 wyodrębniono następujące działy:
Nasze ważne sprawy: przypominamy zasady pracy z komputerem, uczymy podstawowych terminów.
Liczymy: pokazujemy, jak komputer może pomóc i uatrakcyjnić naukę liczenia.
Rysujemy: rozwijamy wrażliwość dzieci na otaczający świat.
Podróżujemy: wpajamy zasady i dobre nawyki podczas korzystania z Internetu, polecamy strony WWW z certyfikatem strony bezpieczne dzieciom.
Piszemy: podpowiadamy, jak ukierunkowana zabawa może pomagać w nauce pisania i czytania.
Dbamy o siebie i innych: pokazujemy jak dbać o siebie, naszych bliskich oraz otaczające nas środowisko. Ważne wydarzenia: proponujemy lekcje okolicznościowe, uczymy, jak celebrować domowe i szkolne uroczystości.